viernes, 22 de febrero de 2019

Acentuación del demonio

¿Son necesarias tantas reglas ortográficas? García-Calvo defendía en el País la necesidad de simplificarlas. Personalmente, soy un convencido de la necesidad de respetar la línea de tiempo en la lengua. Mantener la p de psicología, por fidelidad a la palabra griega original. Mantener la pureza de significados, por ejemplo, la palabra remover, que originalmente era agitar líquidos, los "genios" de la RAE aceptan el anglicismo de remover como quitar ¿Cómo una palabra puede tener significados tan distintos sin comprometer la precisión de una lengua?

Estoy estudiando português, una lengua que amo profundamente. Ayer cuando leí la palabra portuguesa "agoniado" por angustiado casi se me salen las lágrimas porque me recordó a mi madre. Las reglas de acentuación portuguesas son una locura. Sospecho que estas reglas, como decía García-Calvo, están ahí para diferenciar a los que han tenido acceso a la cultura de los que no.

Si aun por encima, no existe un esfuerzo por mantener una serie de palabras comunes entre los países hablantes de la lengua, la deriva es inevitable. Como decía Saramago “Não há uma língua portuguesa, há línguas em português". Por lo que, a pesar de la deriva de vocabulario debemos de hacer un esfuerzo para que la lengua sirva para la comunicación entre pueblos. Para eso, solamente respetando la etimología y el respeto por las palabras vernáculas podemos lograr ese objetivo.
¿Carpeta? ¡No me fastidies!

Cuidado con los test genéticos

En este artículo nos hablan de los riesgos de los test genéticos

Referencias

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0204417

miércoles, 13 de febrero de 2019

Preguntas biología celular

PREGUNTA: ¿Qué función tienen las proteínas COPII en el funcionamiento celular?
Así no: 
Las proteínas COPII son las encargadas de proteger como una caperuza a la mitocondria, de ser comida por las ARN pol dentro de la célula eucariota. Respuesta errónea. Por favor, no reproduzcan esta respuesta.
PREGUNTA: ¿Qué son los SNAREs? ¿Cuál es su función en la célula?

PREGUNTA:  Dineína y cinesina. ¿Qué funciones tienen en la célula? ¿En qué se diferencia una de la otra?

PREGUNTA:  ¿Cómo se mueven las cromátides hermanas con el huso mitótico?

Ejercicios enzimas

1 PREGUNTA: Define grupo prostético. Pon un ejemplo de grupo prostético

Solución: Un grupo prostético es el componente no aminoacídico que forma parte de la estructura de las heteroproteínas o proteínas conjugadas, estando unido covalentemente a la apoproteína. Ejemplos:
2 PREGUNTA: ¿Qué representa el Km de una enzima?

Solución: La Km nos da una idea la afinidad que tiene el enzima por su sustrato, cuanto mayor es Km menor es la afinidad (predominan las formas E y S libres), cuanto menor es Km mayor es la afinidad (predomina la forma ES). La velocidad máxima Vmáx estima el número de centros activos del enzima.

Así no. Ejemplo de pregunta incorrecta. Además "a marcado" hace sangrar los ojos "a travez" por a través, lo mismo, "ocaciones" por ocasiones :(

3 PREGUNTA: La energía de activación de una reacción enzimática es...

Seleccione una:
a. La energía de activación de una enzima es la barrera que tiene que superar la reacción química para llevarse a cabo
b. La energía de activación de una reacción enzimática es la energía del o de los sustratos implicados en la reacción
c. La energía de activación de una reacción siempre tiene un nivel de energía menor que los sustratos o los productos
d. La energía de activación de una reacción enzimática es la energía de los productos obtenidos en la reacción

4 PREGUNTA: El grupo prostético de una enzima es...

Seleccione una:
a. Es el grupo que puede inhibir o aumentar la actividad de una enzima
b. Es un componente no aminoacídico unido covalentemente a la apoproteína
c. Es la coenzima unida a la apoproteína
d. Es un componente aminoacídico unido covalentemente a la apoproteína
e. Es la parte proteica de una holoenzima

5 PREGUNTA: Señala la opción correcta. La Km es...

Seleccione una:
a. Inversamente proporcional a la afinidad de la enzima por el sustrato
b. es una constante universal lo mismo que la velocidad de la luz o la fuerza de gravedad en el planeta Tierra
c. la diferencia existente entre la energía de activación con y sin enzima
d. Directamente proporcional a la afinidad de la enzima por el sustrato

6 PREGUNTA: Las enzimas, señala la opción correcta

Seleccione una:
a. Son sustancias que están en la saliva de la boca
b. Son apilamientos de proteínas (unas enzima de otras?
c. Son proteínas capaces de realizar alguna actividad
d. Son proteínas unidas al ADN
e. Son las encargadas de mantener las reservas energéticas de la célula

7 PREGUNTA: Una enzima alostérica es...

Seleccione una:
a. Aquella que se puede unir a un inhibidor o a un efector que controle su "encendido o apagado"
b. Es la parte proteica de una holoenzima
c. Es una enzima constituida sólo por ARN

8 PREGUNTA: Dados estos valores de concentración de sustrato y de velocidad enzimática

a) ¿Cuál es la Vmax para esta reacción? solución: min 10:50
b) ¿Por qué la Vi (velocidad inicial) permanece constante por encima de 5x104 umol/min? Solución min 11:05
c) ¿Cuál es la constante de Michaelis-Menten de la enzima? Solución min 11:58
d) Calcular la V0 para las concentraciones 1x10-6 y 1x10-1. Solución min 12:40

Para ver el video PINCHA AQUÍ

9 PREGUNTA: Dado los datos
a) ¿Cuál es la Vmax para esta reacción?
b) ¿Dónde se situaría en la gráfica la Km de esta reacción?
c) ¿Por qué no se calcula la Km con la velocidad máxima?

Solución: pincha aquí

10 PREGUNTA: ¿Cuál es la constante de Michaelis-Menten de la enzima?
Solución: 8.3 x 10-6 mol/l

11 PREGUNTA: a) ¿A qué concentración de sustrato podrá una enzima operar a un cuarto de su velocidad máxima (1/4 Vmax), si cuenta con una kcat de 30.0 s-1 y una Km de 0.0050 M?
b) Determine la fracción de Vmax que se obtendría con las siguientes concentraciones de sustrato [S]: 2 Km y 10 Km
la constante catalítica () refleja la máxima velocidad de formación de producto (es decir cuán rápido trabaja la enzima).
Solución: pincha aquí 

12 PREGUNTA:  Una enzima que cataliza la reacción X→Y se aisló de dos especies bacterianas diferentes. Ambas enzimas tienen la misma Vmax pero diferentes valores de Km para el sustrato. La enzima A tiene una Km de 2.0 μM, mientras que la enzima B tiene una Km de 0.5 μM. El gráfico representa las cinéticas de reacción llevadas a cabo con la misma concentración de cada enzima y con [X]= 1 μM. ¿Qué curva representa a la enzima A y cuál a la enzima B?

Solución: pincha aquí

13 PREGUNTA: ¿Qué son los inhibidores enzimáticos? Tipos de inhibición.

Solución: Los inhibidores son moléculas que frenan de forma específica la actividad de las enzimas. Se consideran los siguientes tipos de inhibición:

• Competitiva. El inhibidor es una molécula con una conformación espacial muy similar a la del sustrato, de formaque compite con éste por alojarse en el centro activo, impidiendo así la formación del complejo enzima-sustrato.
• No competitiva. El inhibidor se une a otra región distinta del centro activo y provoca un cambio en la conformación de la enzima que da lugar a una disminución de su actividad.



14 PREGUNTA: Aclarse el significado de las figuras A y B
Solución:
A = inhibición competitiva. El inhibidor competitivo (1) es una molécula tan parecida al sustrato que “compite” por alojarse en el centro activo, impidiendo así la fijación del sustrato y su posterior transformación.

B = inhibición no competitiva. En este caso, el inhibidor no competitivo (2) se une a la enzima en otra región distinta del centro activo y provoca un cambio conformacional que dificulta la interacción con el sustrato, por lo que también disminuye la actividad enzimática.



15 PREGUNTA: ¿Sobre qué trata la cinética enzimática? Indique el significado de las letras minúsculas en el gráfico adjunto.
Solución:
La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas y deduce, a partir de determinados parámetros, la actividad de la enzima, su afinidad por el sustrato y los mecanismos a través de los cuales lleva a cabo la catálisis.

En el eje de abscisas se ha representado la concentración de sustrato, y en el de ordenadas, la velocidad de reacción, resultando una curva hiperbólica que es característica de la mayoría de las enzimas (cinética de Michaelis-Menten).

(a). Cuando la concentración de sustrato es baja la velocidad aumenta de manera prácticamente lineal.

(b). Este punto representa la constante de Michaelis-Menten, es decir, la concentración de sustrato para la cual la velocidad de reacción es la mitad de la máxima.

(c). La velocidad apenas aumenta cuando [S] es muy alta (zona de saturación).


16 PREGUNTA: Aclare la diferencia entre inhibición competitiva y no competitiva con respecto a la KM.

Solución: Las enzimas que siguen la cinética de Michaelis, en presencia de inhibidor competitivo, tienen la misma velocidad máxima y diferente KM, mientras que en presencia de inhibidor no competitivo, tienen la misma KM puesto que el sustrato mantiene su capacidad de unión a la enzima, pero diferente velocidad máxima ya que la enzima pierde capacidad catalítica.

17 PREGUNTA: Aclare el significado de A, B, C y D en el esquema adjunto.
 

Solución: En la mayoría de las reacciones enzimáticas, la velocidad inicial va aumentando en función de la concentración de sustrato, hasta aproximarse de manera asintótica a un valor máximo. Se observa que, en la llamada “zona de saturación”, el incremento de V es apenas significativo por mucho que aumente [S].

A = velocidad máxima.
B = zona de saturación
C = constante de Michaelis-Menten (KM), es decir, la concentración de sustrato que se corresponde con la mitad de la velocidad máxima (D).


18 PREGUNTA: cómo afectan las mutaciones del ADN en la atracción del sustrato por el sitio activo de la enzima

Los aminoácidos a, b, c y d son hidrofílicos y están codificadas por a) TCT (Serina), b) TCC (Serina), c) TCA (Serina) y por d) AAA (Lisina). 

i)   ¿Cómo afecta que el triplete de a pase de TCT -> TCG?
ii)  ¿Cómo afecta que el triplete de b pase de TCC -> TAC?
iii) ¿Cómo afecta que el triplete de c pase de TCA -> TAA?
iv) ¿Cómo afecta que el triplete de d pase de AAA -> GAA?

i) La mutación no tiene efecto porque TCG también codifica para la Serina. Por lo tanto esta mutación no afecta al sitio activo de la enzima
ii) La mutación genera que en vez de Ser (que es un aminoácido pequeño con un OH) se traduzca una tirosina. La tirosina es más grande que la serina, pero tiene también un grupo OH. Por lo tanto, el mayor tamaño dificultase la entrada del sustrato en el sitio activo, pero a nivel de generación de puentes de hidrógeno no habría ninguna diferencia porque la tirosina, al igual que la serina, tiene un OH. 
iii) La mutación de la serina c de TCA -> TAA un codon de STOP, implica que el aminoácido serina desaparezca y que los aminoácidos posteriores a esta serina c desaparezcan.
iv) La mutación de la lisina d, un aminoácido básico, a un aminoácido ácido glutámico, un aminoácido ácido genera que va a haber una repulsión entre el sustrato y el centro activo de la enzima.



viernes, 1 de febrero de 2019

Tesis y tesistas bungee

Las tesis de fin de carrera en Ecuador presentan dos problemas: los tesistas bungee que son esos que te llaman muy animosos para hacer una tesis y nunca más te vuelven a llamar.
Los comics de Dilbert son una delicia. Aquí he adaptado uno para reflejar la situación con los tesistas "bungee" los que te piden muy interesados hacer una tesis y desaparecen tan rápido como aparecieron. Fuente
El otro problema es el requerimiento de escribir un marco teórico. Cuando yo hice mi tesis doctoral, el primer día ya estaba trabajando en los experimentos. En la Universidad Autónoma de Madrid te pedían que la tesis no superase las 30 hojas. Hoy lo que se hace es escribir una introducción y adjuntar los artículos científicos generados
Uno de los errores más comunes en Ecuador a la hora de hacer tesis es dedicarle más tiempo al marco teórico que a hacer el propio trabajo de la tesis
La tercera cosa que me desagrada, pero esto ya no es exclusivo del Ecuador, son los gestores científicos metiendo las narices en la ciencia y exigiendo que en el proyecto especifiques cuáles van a ser los resultados ¿Si ya se los resultados a priori para qué hacer ciencia?