b) ¿Cuántos nucleótidos codificantes tiene este gen?
c) Amplifica el gen utilizando dos primers de 6 nucleótidos cada uno.
Solución:
a)
b) 42 nt totales, 39 nt codificantes
Primer A 5' CTAGTC 3'
Primer B: 5' ATGCAT 3'
PREGUNTA 3 (examenC). i) Tengo dos bacterias: A y B. La bacteria A tiene un cromosoma con 8000 genes y se divide en dos bacterias cada 40 minutos. La bacteria B tiene 5000 genes. ¿Cuánto tiempo tarda B en dividirse?. ii) ¿Cuántas bacterias dejará de descendencia la bacteria A y cuántas la bacteria B tras 3 horas de crecimiento
Solución: La bacteria se divide cada 25 min. Se resuelve con una regla de tres, si 8000 genes en 40 min, para 5000 genes tenemos...
180 min / 40 min = 4.5 generaciones. 2 elevado a 4.5 = 22 bacterias
180 min / 25 = 7.2. 2 elevado a 7.2 = 147 bacterias
PREGUNTA 4 (ExamenD). Si en España con 47 millones de habitantes se contagian con el SARS-CoV-2 el 80% ¿Cuántos muertos habría teniendo en cuenta que la tasa de letalidad es del 1%? ¿Y en Ecuador, con 17 millones de habitantes, cuántos muertos habría?
Solución: el 80% de 47 millones es 37.600.000. Si se muere el 1% de los 37.5 millones de infectados entonces mueren 376.000. En Ecuador el 80% de la población infectada sería 13.6 millones. Mueren 136.000 personas.
PREGUNTA 5 (ExamenD). ¿Qué le ocurriría a un virus cuando por una mutación su R0 es menor que 1?
Solución: R0 significa el número de medio de personas que va a infectar una persona infectada previamente con este virus. Si R0 < 1 significa que la infección de este virus cada vez va a infectar a menos personas y en breve este virus dejará de infectar a la población.
PREGUNTA 6: En el cultivo de la izquierda tengo 1 ml de un cultivo de 64000 bacterias. ¿Cómo se harían las siguientes diluciones?:
Solución: la relación entre los tubos revela una dilución 1:4. Por tanto, podemos tomar 250 ul del primer cultivo y añadirle 750 ul de medio para tener una dilución de 1:4. Para hacer diluciones seriadas lo que se haría es tener tubos con 750 ul de medio y al primer tubo con 750ul de medio fresco añadirle 250 ul del cultivo, y así sucesivamente
PREGUNTA 7 (ExamenE) En el siguiente diagrama tenemos en una bacteria sensible a los antibióticos fosfomicina, ciprofloxacina y ceftazidima. Si esa bacteria que crece en A la volvemos a crecer en B y observamos un mutante (marcado con una flecha) y ese mutante lo crecemos en C, aparece otro mutante (flecha). Si utilizamos ese mutante para crecerlo en D y ahí aparece otro mutante (flecha) y ese mutante lo utilizamos para crecerlo en E. Describe el porqué de la aparición de resistencia a los tres antibióticos.
Solución: En B hemos seleccionado un mutante que confiere resistencia a la fosfomicina. Cuando en C volvemos a crecer esta bacteria vemos que la fosfomicina ya no es activa. Si aparece ahora otra mutante a la ciprofloxacina y lo crecemos en D, observamos que la bacteria, que ahora tiene dos mutaciones, una que le confiere resistencia a la fosfomicina y otra mutación que le confiere resistencia a la ciprofloxacina, cuando está bajo la actividad de la cefotaxima (CTX) este antibiótico selecciona un mutante (señalado por la flecha). Si cogemos este mutante y lo crecemos en E vemos que ahora que hemos seleccionado tres mutantes de la bacteria original, lo que tenemos es una bacteria resistente a los tres antibióticos.
PREGUNTA 8 (ExamenE) ¿Un antibiótico puede matar un virus? Razona tu respuesta
PREGUNTA 10: (ExamenF): Tengo dos bacterias: A y B. La bacteria A tiene un cromosoma con 10.000 genes y se divide en dos bacterias cada 40 minutos. La bacteria B tiene 5000 genes y se divide cada 20 min. Tras 5 horas de crecimiento ¿Cuántas más bacterias (ratio) dejará de descendencia la bacteria A respecto a B?
Solución: 5 horas son 300 min. A en 300 min se divide 7.5 veces. 2 elevado a 7.5 = 181 bacterias
300 / 20 = 15. 2 elevado a 15 = 32.768. Es decir hay 181 veces más bacterias B que A a las 5 horas
PREGUNTA 12:
Canis lupus lupus A: AGGCATCAGTAGCTCTGAAACACGCCCGCGATTCGTCGAACTGTC
Vulpes lagopus B: ACGCATCACTAGCTCTGCTACACGCGCGCGAATCGTCGTACTGAC
Canis familiaris C: ATGCATCAGTAGCTCTGGAACACGCCCGCGATTCGTCGAACTGAC
Construye el árbol genealógico de estos tres cánidos. ¿Cuántas diferencias existen entre ellos?
Solución: ejercicio 3 de este enlacePREGUNTA 13: Tengo dos bacterias: A y B. La bacteria A tiene un cromosoma con 15.000 genes y se divide en dos bacterias cada 40 minutos. La bacteria B tiene 5000 genes y se divide cada 20 min. Tras 6 horas de crecimiento ¿Cuántas más bacterias (ratio) dejará de descendencia la bacteria A respecto a B?
360 min /40 = 9. A tiene 512 bacterias a las 6 hr
306/13.3 = 27. B tiene 2 elevado a 27 = 134.217.728. B tiene 262.144 veces más células
PREGUNTA 15: Sitúa los enlaces peptídicos y di cuántos aminoácidos hay en este péptido?
Solución:
PREGUNTA 16: ¿Por qué todos los virus en algún momento de su ciclo vital tienen que tener su información en forma de ARN? Pista: tiene que ver con los árboles filogenéticos
Todos los virus tienen un intermediario ARN porque TODOS los virus son descendientes de un organismo precursor formado de ARN. O dicho de otra manera: todos tenían un antepasado común basado en ARN.
SOLUCIÓN: los alumnos que no estudian y no tienen el nivel requerido
¿Quién tiene la culpa de haber despedido de la universidad a este profesor?
SOLUCIÓN: Primero, sus superiores por haber escuchado los ruegos de los malos alumnos. Segundo, los alumnos que presionaron utilizando argumentos que los docentes estamos cansados de oir para conseguir el despido de ese docente que es una barrera entre ellos y sus sueños. Tercero, un sistema universitario que considera a los alumnos clientes.
Visto por estos ojitos que se los va a comer la tierra
Dar de beber al sediento
Toda persona con sed merece un vaso de agua. El que se muere de sed y no bebe... se muere. Por lo tanto, el agua puede tener un coste de depuración y de distribución, pero no puede ser un bien sometido a las leyes de mercado. Existe una obligación moral que antecede y que está por encima de las leyes del mercado. Con la educación sucede lo mismo.
Está bien que existan instituciones de educación privadas. Faltaría más. En su libro "El conflicto de las facultades" Kant , propone que, la moral y la ética nace de la libertad; porque solamente en libertad se puede cumplir con el deber, que nace del derecho. Solamente, en libertad, en autonomía, el hombre es capaz de comprometerse. Esto tiene validez atemporal y aespacial y por ello es universal. Las universidades históricas y modernas, para producir conocimiento, deben basarse en esta premisa fundamental de la autonomía como derecho universal para reproducir incesantemente el saber.
Diferencias entre bonobos (Pan paniscus), una especie similar a los chimpancés, de organización matriarcal. Los chimpancés (Pan troglodytes) tienen una estructura patriarcal que favorece una estructura basada en la fuerza de los machos y la lucha por el territorio. Fuente.
Hace cuatro décadas que la excelente primatóloga Jane Goodall nos reveló que nuestros primos los chimpancés también van a la guerra, llevándola hasta las más sangrientas y crueles consecuencias. Las implicaciones sobre lo que esto supone en términos evolutivos son muy interesantes, dado que humanos y chimpancés eligieron este tipo de conflictos territoriales frente a sus parientes más próximos, los bonobos, un matriarcado pacifista. Pero hay muchos mecanismos presentes en esa conducta que todavía están por descubrirse.
La oxitocina es un arma de doble filo: ayuda a fortalecer los lazos del grupo pero también despierta agresividad hacia los demás Por ejemplo, el factor hormonal y el papel que desempeñan en los conflictos de humanos y chimpancés. Un estudio acaba de mostrar un aumento notable de los niveles de oxitocina en la orina de los chimpancés cuando se encuentran en guerra con otro grupo rival. Esta hormona sufrió el apelativo de "hormona del amor" durante mucho tiempo porque estaba asociada a la consolidación de relaciones sociales humanas de pareja y de la madre hacia su bebé. Ahora, también podemos certificar que es la hormona de los hermanos de armas, según el trabajo de los investigadores del Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva que firman este trabajo. Ya se habían observado altos niveles de oxitocina en chimpancés después de compartir comida y de asearse y acicalarse mutuamente. Pero se presuponía que también producirían esta hormona en situaciones conflictivas en las que la coordinación entre los individuos del grupo es esencial para su supervivencia. Tras seguir a los chimpancés de Taï, en Costa de Marfil, los investigadores observaron ese aumento de oxitocina mientras se encontraban en escenarios de hostilidad con otros grupos. En estas situaciones, por ejemplo, los animales apenas abandonaban la unidad del grupo en comparación con otros momentos en los que reina la paz y cada chimpancé se mueve con más libertad.
En un experimento virtual, esta hormona multiplicaba las opciones de que estudiantes holandeses sacrificaran la vida de un musulmán "Nuestros resultados sugieren que el comportamiento de cohesión del grupo entre los chimpancés frente a la amenaza exterior se apoya probablemente en el mismo mecanismo fisiológico sugerido para el altruismo parroquial humano, el sistema oxitocinérgico", concluyen los investigadores. En este sentido, varios estudios recientes han ayudado a entender cómo se activa esta hormona no sólo en situaciones amorosas. En situaciones más oscuras, como cuando nos envuelven escenarios bélicos o racistas, los humanos también nos servimos de la oxitocina para encerrarnos con más fuerza en nuestra parroquia frente al enemigo o al distinto.
En 2010, la revista Science publicó un trabajo liderado por Carsten De Dreu en la que se mostraba a las claras que la oxitocina es un arma de doble filo: consolida el amor del grupo y despierta la agresividad hacia los ajenos. Tras inhalar la hormona, los sujetos estudiados tomaron decisiones más lesivas contra los grupos que no eran el suyo. Estos resultados llevaron a hablar incluso de la posibilidad de usarla en soldados. Posteriormente, usó este método para mostrar que al inhalar oxitocina los humanos nos volvemos más xenófobos: en un experimento virtual, multiplicaba las opciones de que estudiantes holandeses sacrificaran la vida de un musulmán.
"El estímulo que desencadena la liberación de oxitocina en contextos intergrupales, sin embargo, sigue siendo desconocido para los seres humanos o los chimpancés", escriben ahora los investigadores del Max Planck. Y añaden: "La necesidad fundamental de un apoyo dentro del grupo en tiempos de conflicto entre grupos no es únicamente humana, sino que aparentemente también está presente en uno de nuestros parientes vivos más cercanos, el chimpancé".
Palo-zanahoria, bloqueo mental por agotamiento, repetición y
contradicciones, fuera-frío dentro-calor, aislamiento del
exterior/constante interacción con el grupo (repito, este tipo de
interacciones también se dan en la ciencia), de esa manera se doblega lo
individual, las conexiones sociales previas y la adherencia al nuevo
grupo.
La evolución molecular y la evolución lingüística comparten muchas características en común; tanto los genes como las palabras evolucionan siguiendo procesos similares: herencia, variación y selección. Estos procesos dan como resultado una gran diversidad de palabras, genes y proteínas, por ejemplo, las diferentes formas de decir hecho en Europa, o las distintas formas de hemoglobina en los humanos. Los genes y las palabras son capaces además de representar la distribución geográfica de las poblaciones humanas: su filogeografía. A lo largo de la historia, los pueblos se han dispersado por el mundo hacia nuevos territorios, como es el caso del Imperio Romano, que se expandió desde la actual Italia hasta ocupar gran parte de Europa. Con las migraciones y establecimiento de poblaciones en distintas regiones, surgieron nuevas variaciones en sus acervos genéticos y en las palabras que utilizaban. La proporción de algunos genes y el uso de algunas nuevas palabras prevalecieron sobre la proporción y el uso de otras, por lo que fueron seleccionados, dando lugar a nuevas lenguas y nuevos acervos genéticos.
Otra característica común entre los genes, las proteínas y las palabras, es que se representan con letras. Nuestro alfabeto contiene 27 letras, el ADN se representa con 4 y la estructura primaria de las proteínas con 20. En las lenguas, se distinguen palabras que por sus similitudes fonéticas y por tener el mismo significado en distintos idiomas, se intuye que tienen un origen común. Estas palabras se denominan cognados y son análogas a los genes o proteínas homólogas. La palabra en castellano hecho conserva el mismo significado que su origen latino factu y es mantenido por el resto de los cognados a través de distintos idiomas europeos. Similarmente, a medida que los seres vivos evolucionan y se diversifican, ciertos genes y proteínas cambian a estructuras distintas que pueden conservar una identidad apreciable y la misma función. Por ejemplo, la secuencia de la insulina en los mamíferos es muy similar entre especies y tienen la misma función.
Los cambios que se producen en las secuencias de nucleótidos de los genes a través de la evolución son los mismos que se producen durante la evolución de las palabras, y pueden ser de tres tipos: Inserciones (incorporaciones de nucleótidos/aminoácidos/letras a la secuencia original), deleciones (pérdida de nucleótidos/aminoácidos/letras) y sustituciones (cambio de nucleótidos/aminoácidos/letras por otras). Observemos con detenimiento la siguiente tabla con 10 cognados de la palabra hecho. La evolución de factum (latín culto) a factu (latín vulgar) es un ejemplo de deleción, mientras que el cambio de factu a facto (romance) muestra una sustitución.
El alineamiento de secuencias nos permite comparar dos o más secuencias de nucleótidos o aminoácidos para determinar las similitudes entre ellas. Para este ejercicio, realiza un alineamiento de los cognados de hecho, cuenta las diferencias puntuales (letras distintas) en cada par de palabras y llena la tabla adjunta.
Ahora calcula la distancia proporcional entre cada par de palabras y anótalo en la Tabla 6.3. La distancia proporcional entre dos secuencias (o palabras en este caso) se refiere al número de diferencias puntuales entre dos secuencias dividido para el número total de caracteres de la secuencia (número de nucleótidos/letras de la secuencia o palabra más larga).
Conociendo la distancia proporcional podemos construir el árbol filogenético a través del método neighbor joining o unión de vecinos. Primero buscamos los vecinos más próximos, es decir, el par de palabras que posean la distancia proporcional más pequeña y se las conecta con dos ramas que se unen en un nudo, el cual representa al ancestro común de ambas. Tomamos la siguiente palabra más cercana a nuestra pareja de palabras, contamos las diferencias, calculamos el promedio de diferencias y luego la distancia proporcional. Seguimos este procedimiento con todas las palabras que vayan a conformar el árbol filogenético.
Vamos a construir un árbol filogenético con los siguientes
5 cognados: Hecho, fecho, feito, fact y factum. Llena la tabla adjunta y completa el árbol presentado en la
Figura 6.1.
Figura 1. Completa el árbol filogenético de los 5 cognados de
hecho.
Figura 2. Filogeografía de los cognados. Sitúa las palabras de los 5 cognados de hecho en el mapa
Ejercicio 2: La filogeografía es un criterio para definir un orígen común, funciona tanto para palabras como genes. Las palabas y los genes tienen un origen común y un espacio común que comparten. La palabra dos del castellano tiene su origen en una palabra indoeuropea. Esta palabra es común para todas la lenguas que proceden del indoeuropeo. Con este ejercicio se pretende subrayar el que las palabras comunes también tienen una distribución geográfica común. Con los genes ocurre exactamente lo mismo.
¿Podrías situar la palabra dos en sus versiones germánica, eslava, celta, y latina en el mapa de abajo?
Ejercicio tres. Métodos de distancias. Si tomamos como punto de partida Guayaquil podemos conectarnos con todas las ciudades del Ecuador. Habrá ciudades que estén más cerca que otras. Las que están más cerca tienen, obviamente, menos Km que las que están más lejos. Con las secuencias genéticas pasa lo mismo. Aquellas que tienen menos cambios con la secuencia que queremos comparar serán las que están más próximas en el árbol genealógico.
Por ejemplo, si quiero que se ordene las ciudades que se conectan a Guayaquil en la vía a Colombia quedaría así:
El orden se crea en relación a un punto de partida, que en este caso es Guayaquil. El total del viaje hasta la frontera con Colombia en Ipiales es de 674 km. Por lo tanto, si estás en Babahoyo habrás recorrido 83/674 km = 0.12, es decir, habrás hecho el 12% del trayecto. Si estás en Ibarra habrás recorrido 535/674 = 0.79, es decir el 79%.
¿Cuál sería el orden de las ciudades de Guayaquil a Perú?
Ejercicio 3. Árbol filogenético de tres monos emparentados.
Ahora vamos a ver un ejemplo genético. En filogenética, la distancia evolutiva no es una distancia métrica matemáticamente hablando, la distancia evolutiva es una magnitud que mide la separación entre secuencias. Por ejemplo, tenemos tres tipos de monos ecuatorianos: A Mono capuchino de la Costa (Cebus aequatorialis); B Mono araña de la Costa (Ateles fusciceps) y C Capuchino de cabeza blanca (Cebus capucinus).
Como podemos ver, existen tres posibilidades de que estos tres monos estén relacionados:
Lo más normal es que los dos monos capuchinos estén emparentados y el árbol más probable sea ii. Sin embargo, a pesar de lo aparente debemos de dar un argumento genético.
SOLUCIÓN: Si consideramos las tres secuencias podemos establecer que la distancia entre ellas
Ahora bien, debemos de referir esa distancia a la secuencia de que partimos, la secuencia de 45 nt. ¿Por qué? pongo un ejemplo. Estamos viendo diferencias entre palabras. Imaginemos dos escenarios, A y B:
A Elarzobispodeconstantinopla
Elarzobispodemonstantinopla
Entre las dos palabras hay una diferencia
B Hecho
Fecho
Entre las dos palabras solo hay una diferencia también.
¿Es el mismo caso? No porque en el caso A es 1/27 = 0.03 y en el caso B 1/6 = 0.17
Por lo tanto, en nuestro ejercicio tenemos que poner las distancias relativas a los 45 nt que tiene la secuencia.
Distancia relativa A-B: 8/45 = 0.17
Distancia relativa B-C: 7/45 = 0.15
Distancia relativa A-C: 3/45 = 0.06
Basándonos en estas distancias deducimos que los monos capuchinos son las especies más cercanas y formarían un grupo ("Cerezas" se le llama en la jerga genética porque parecen dos cerezas unidas por sus rabitos), mientras que el mono araña es el más alejado.
La distancia entre A y C es de 0.06, la distancia al nodo común, al ancestro común de los capuchinos es de 0.03. Vamos a calcular la rama hasta que encontremos el nodo correspondiente al ancestro común de los tres monos:
(Distancia A-B + distancia B-C)/2 = (8+7)/2=7.5. 7.5 Cambios en 45
7.5/45= 0.17. Por lo tanto, la distancia del mono araña hasta el común ancestro es de 0.08
Para saber más:
Una vez que se ha establecido un modelo de evolución, la distancia filogenética entre dos secuencias se define como la cantidad que estima el máximo de verosimilitud de la cantidad de cambios acumulados entre las dos secuencias durante la evolución. Por ejemplo, para el modelo evolutivo más sencillo, el denominado modelo de Jukes-Cantor, el número de cambios esperados entre dos secuencias de ADN es
-3/4 * ln(1-4p/3) si p es la fracción de nucleótidos distintos entre las dos secuencias. Esa cantidad se llama distancia de Jukes-Cantor.
Distancia Jukes-Cantor A-B: -3/4 * ln((1-4*8)/3, pero esto queda para un curso más avanzado.
En Santiago de Compostela existe el tercer museo más antiguo de Europa dedicado a la anestesia. En esta ciudad se utilizó el cloroformo como anestésico por primera vez en España, fue en 1847 y no mucho después de la primera demostración que se hizo en el mundo (Estados Unidos, 1846). Y es que Antonio Casares, químico extraordinario, sintetizó el cloroformo y pudo utilizarse de forma pionera en la comunidad.
En 1947 se usó en Santiago la primera anestesia general con éter. La capital gallega fue pionera en España en el campo de la anestesia porque tres cirujanos (Puente Domínguez, Fernández Albor y Baltar) enviaron en la década de los 40 y los 50 del pasado siglo a formarse en anestesia a otros cirujanos a Estados Unidos y Reino Unido
No se si es márquetin de guerrilla, o que demonios es esta publicidad de la Universidad Técnica Equinocial de Quito. La UTE es una buena universidad para los estándares ecuatorianos. Conozco gente muy competente ahí. No sé que les habrá pasado por la cabeza
Supongo que la publicidad está dirigida a padres y madres que quieren seguir manteniendo a sus hijos como niños pequeños
"If you are interested in volunteering for the benefit of word scientists" ¡Qué tres grandes mentiras para disfrazar trabajo sin remunerar! -estar interesado- voluntariado- para beneficio de los científicos del mundo- Más arriba habla de "colaboración mutua" Con que gracia apela el capitalismo al mutualismo y la colaboración cuando se trata de que trabajes gratis. Esto contrasta con lo agresivos que son cuando te aceptan un artículo científico en la revista para que les pagues los 2400$. Te inundan de correos: paga, paga ya, PAAAGAAAA. Te adulan, te hacen trabajar y luego te dan "beneficios" como un certificado, asistencia a un congreso que seguro te hacen organizar...
Lo de la industria de las editoriales open access es para hablar otro día. Lo de hoy es para señalar cómo lo lúdico tiene un "valor". Intentan pagarte con ese valor ficticio. Vas a jugar, vas a ser científico...
Debido a que fueron sepultadas bajo los piroclastos, Pompeya y Herculano son dos ciudades detenidas en el tiempo. Dos ciudades de un imperio que se expandió a Francia y a la Península Ibérica y de ahí a América y África en donde se mantiene esa cultura a través del idioma y la religión Católica Romana. Cultura, idioma y la estructura en como se organiza la religión son deudoras de lo que se desentierra en Pompeya y Herculano.
El pueblo armenio ha sufrido dos intentos de aniquilación. El primero por los turcos durante el genocidio armenio. Se calcula que murieron entre 600.000 y 2 millones de personas. Se llevó a cabo entre 1915 y 1923. Cuando el mundo estaba ocupado de la Primera Guerra Mundial y sus heridas. El segundo se está llevando a cabo por otro pueblo musulman, los azeríes. Esta vez tratan de aniquilar su memoria eliminando la herencia cultural armenia.
Arrasar el cementerio medieval de la ciudad de Julfa es una estrategia para conquistar un territorio
La vida sexual de las hienas es apasionante. Como animales que compiten en el mismo territorio con otra especie más poderosa físicamente: los leones, la agresividad es un componente esencial de la estructura social. La agresividad no solo está controlada por la testosterona del grupo, un parásito,Toxoplasma gondii hace que muchas crías de hienas sean tan agresivas contra los leones que se conviertan en auténticos kamikazes que consiguen que los leones se los piensen dos veces antes de atacar al grupo.
El territorio es a los machos lo que el útero a las hembras
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