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miércoles, 19 de junio de 2024

Práctica carbohidratos

¿Qué es la prueba de glucosa en la orina?

La prueba de glucosa en la orina mide la cantidad de glucosa que hay en la orina. La glucosa es un tipo de azúcar. Es la principal fuente de energía de las células en el cuerpo. Su sangre lleva la glucosa a las células.

Normalmente, la orina contiene muy poca o nada de glucosa. Pero si tiene demasiada glucosa en la sangre, los riñones se desharán de la glucosa extra a través de la orina. Por ello, un nivel alto de glucosa en la orina puede significar que su glucosa en la sangre es alta también, lo que puede ser una señal de diabetes. Si su nivel de glucosa en la orina es alto, su profesional de la salud puede solicitar una prueba de glucosa en sangre para ayudar a hacer un diagnóstico.

Identificación de polisacáridos con lugol

Introducción

Las plantas almacenan energía por medio de un polisacárido de nombre almidón, el cual se conforma de largas cadenas de moléculas de glucosa unidas mediante enlaces glucosídicos. El contenido de almidón varía dependiendo de la planta. El almidón se obtiene, por lo general, del maíz, el trigo, el arroz, la patata o la yuca. Si proviene de un tubérculo suele denominarse fécula; si es de un cereal, almidón. Las propiedades del almidón varían en función del producto del cual se extrae. Ello se debe a la longitud de las cadenas, el tamaño y forma del grano del almidón y sobre todo, a la proporción de los dos tipos de cadenas que lo forman (amilosa y amilopectina). La amilosa (lineal) hace predominar la estructura gelificada ya que forma tramas tridimensionales; la amilopectina (ramificada) produce en los líquidos una mayor viscosidad, es por esto que el arroz con una proporción elevada de amilopectina resulta muy viscoso y pegajoso y por tanto, muy apropiado para la elaboración de sushi.

Fig. 1. Molécula del almidón

 La prueba del yodo, Lugol, es una reacción química usada para determinar la presencia o alteración de almidón u otros polisacáridos. El reactivo de Lugol, que contiene una mezcla de yodo y yoduro, permite reconocer polisacáridos, particularmente el almidón por la formación de una coloración azúl-violeta intensa y el glucógeno y dextrinas por la formación de coloración roja. Esta reacción es el resultado de la formación de cadenas de poliyoduro a partir de la reacción del almidón con el yodo presente en la solución de Lugol. La amilosa, el componente del almidón de cadena lineal, forma hélices donde se juntan las moléculas de yodo, formando un color azul oscuro a negro.

Hipótesis

La prueba de Lugol será positiva en aquellas verduras o frutas con mayor cantidad de almidón, como por ejemplo la papa, mientras que en otras como la frutilla su coloración no será tan intensa, el agua no debe presentar reacción alguna por lo que funciona como control negativo del experimento

Materiales

Lugol
1 papa
50 gr de hígado de pollo
1 fresa
placas petri o tubos de ensayo
gotero
manojo de espinacas
agua
parrilla
vaso de precipitado
tubos falcon de 15 ml

Procedimiento

Colocar una muestra de cada fruta y verdura dentro de los tubos de ensayo, colocar con el gotero unas cuantas gotas de lugol y observar la coloración de cada muestra. Calentar a baño maría los tubos y observar el cambio de color.

 Resultados

La coloración producida por el Lugol se debe a que el yodo se introduce entre las espiras de la molécula de almidón, entre mayor sea la cantidad de almidón, más intensa será la coloración.

Por lo tanto, en la papa  las coloraciones deben ser intensas, mientras que en la fresa no tanto. El agua no genera ninguna reacción. Con la muestra de hígado el Lugol reacciona por la presencia del glucógeno, pero la coloración es más rojiza que azul-violeta. La coloración que desaparece al calentar, porque se rompe la estructura que se ha producido, pero vuelve a aparecer al enfriar la muestra.

Video 1: Prueba de Lugol (Yodo-Yoduro) al Almidón Hidrolizado y sin Hidrolizar

Curiosidad:

El parásito protozoario, Iodamoeba buschilii, tiene una gran vacuola de glucógeno que toma color café cuando se tiñe con lugol.

Fig. 2. Iodamoeba bütschlii. Quistes de forma y tamaño variables con vacuolas de glucógeno de color marrón oscuro. Concentración fecal por flotación con sulfato de zinc (método de Fausto). Teñido con solución de yodo de Lugol. Objetivos 40x y 100x.
Foto: ©Nemeckova

Test de Benedict

El test de Benedict es el más usado para detectar presencia de glucosa en la orina. Cuando se detecta cierta cantidad de glucosa en la orina podemos sospechar que el paciente padece de diabetes.

Este método detecta azúcares reductores que son los que tienen su OH del C anomérico libre. Como la mayoría de los azúcares están en forma cíclica, el reactivo de Benedict es básico, esto lineariza a los carbohidratos cíclicos como la glucosa dejando su OH del carbono anomérico libre y listo para reaccionar con el reactivo de Benedict.

Fig. 3. El método de Benedict se basa en la reducción de algunos iones metálicos por la glucosa dando un cambio en la coloración. Gracias a este método podemos determinar si existen carbohidratos en nuestra muestra


Esta reducción de los iones metálicos como el Cu++ no es específica de la glucosa. Por lo tanto, la reacción puede ser originada por cualquier sustancia reductora presente en la orina (creatinina, ácido úrico, ácido ascórbico y otros azúcares reductores). El fundamento de esta reacción radica en que, en un medio alcalino, el ion cúprico Cu++, que es cedido por el sulfato cúprico CuSO4, es capaz de reducirse por efecto del grupo aldehído del azúcar (CHO) a su forma cuprosa Cu+. Este nuevo ion se observa como una precipitado rojo ladrillo correspondiente al óxido cuproso Cu2O
Fig. 4. Resultados colorimétricos test de Benedict

‐ Poner en una gradilla cuatro tubos de ensayo, numerados del 1 al 4.
‐ Añadir en cada tubo 2 mL. de una solución diluida del azucar que se vaya a utilizar.
‐ A los tubos 3 y 4 añadir una pequeña cantidad de saliva.
‐ En el tubo 1, realizar la Reacción de Benedict: Añadir 1 mL de reactivo de Benedict y mezclar. Colocar el tubo a baño maría a 70°C, durante 5 minutos y luego dejar enfriar.
‐ En el tubo 2, realizar la Reacción de Lugol.
‐ Poner en el baño María a 37°C, a los tubos 3 y 4 (que contienen el almidón y la saliva), controlando la temperatura debido a que la enzima de la saliva funciona a 37°C. Dejar los tubos en el baño María durante 15 minutos.
‐ A continuación, realizar las siguientes reacciones: en el tubo número 3, realizar la Reacción de Fehling o Benedict. En el tubo número 4, realizar la Prueba del Lugol.

Fig. 5. Tubo 1: almidón más tinción de Benedict calentado a 70ºC para acelerar la reacción. Tubo 2: almidón más Lugol a temperatura ambiente. Tubo 3: almidón más saliva a 37ºC más tinción de Benedict. Tubo 4: almidón más saliva a 37ºC más Lugol.

Test de Fehling

Gracias al Instituto de Calamocha por la práctica

Fig. 6. La reacción de Fehling nos permite estudiar los azúcares reductores. Fuente

FUNDAMENTO Los monosacáridos y la mayoría de los disacáridos poseen poder reductor, que deben al grupo carbonilo que tienen en su molécula. Este carácter reductor puede ponerse de manifiesto por medio de una reacción redox llevada a cabo entre ellos y el sulfato de Cobre (II). Las soluciones de esta sal tienen color azul. Tras la reacción con el glúcido reductor se forma óxido de Cobre (I) de color rojo. De este modo, el cambio de color indica que se ha producido la citada reacción y que, por lo tanto, el glúcido presente es reductor. Esta propiedad permite determinar la concentración de una disolución de azúcar midiendo la cantidad de agente oxidante que es reducido, como ocurre en la determinación del contenido de glucosa en muestras de sangre u orina para detectar la diabetes mellitus.

TÉCNICA 

1. Poner en los tubos de ensayo 3ml de la solución de glucosa, maltosa, lactosa fructosa o sacarosa.

 2. Añadir 1ml de solución de Fehling A (contiene CuSO4) y 1ml de Fehling B (lleva NaOH para alcalinizar el medio y permitir la reacción) 

3. Calentar los tubos a la llama del mechero hasta que hiervan.

4. La reacción será positiva si la muestra se vuelve de color rojo y será negativa si queda azul o cambia a un tono azul-verdoso. 

5. Observar y anotar los resultados de los diferentes grupos de prácticas con las distintas muestras de glúcidos

Fig. 7. Reacción de Fehling. Fuente

Hidrólisis de la sacarosa

FUNDAMENTO La sacarosa es un disacárido que no posee carbonos anoméricos libres por lo que carece de poder reductor y la reacción con el licor de Fehling es negativa, tal y como ha quedado demostrado en el experimento 1. Sin embargo, en presencia de ClH y en caliente, la sacarosa se hidroliza, es decir, incorpora una molécula de agua y se descompone en los monosacáridos que la forman, glucosa y fructosa, que sí son reductores. La prueba de que se ha verificado la hidrólisis se realiza con el licor de Fehling y, si el resultado es positivo, aparecerá un precipitado rojo. Si el resultado es negativo, la hidrólisis no se ha realizado correctamente y si en el resultado final aparece una coloración verde en el tubo de ensayo se debe a una hidrólisis parcial de la sacarosa.

Fig. 8. Sacarosa

TÉCNICA

1. Tomar 3ml de solución de sacarosa y añadir 10 gotas de ClH diluido.

2. Calentar a la llama del mechero durante unos 5 minutos.

3. Dejar enfriar.

4. Neutralizar añadiendo 3ml de solución alcalina.

5. Realizar la prueba de Fehling como se indica en el experimento 1.

6. Observar y anotar los resultados.

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Aprovechando que tenemos hígado...

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EJERCICIOS: 

EJERCICIO 1: Describe qué ocurre en esta reacción. a) ¿Por qué el almidón en presencia de lugol se vuelve azul? b) ¿Por qué cuándo se enfría se vuelve incoloro? c) ¿Por qué se vuelve a colorear cuando se calienta?


EJERCICIO 2: Describe lo que ocurre en la reacción. A) Fehling positiva B) Fehling negativa
Respuesta incorrecta: La reacción A va a cambiar de color porque es positiva mientras que la reacción B no porque es negativa.

Solución: el cambio de color que se origina en las reacciones positivas se debe al carácter reductor de los monosacáridos y de la mayoría de los disacáridos (excepto la sacarosa). Si el glúcido que se investiga es reductor, se oxidará dando lugar a la reducción del sulfato de cobre, de color azul, a óxido de cobre, de color rojo-anaranjado.

EJERCICIO 3: Normalmente, la orina contiene muy poca o nada de glucosa. ¿Por qué crees que ocurre esto? Relaciona tu respuesta con la primera reacción que tiene lugar en la glucólisis.

EJERCICIO 4: Tengo hojas de espinaca congelada ¿Afecta al peso que estén a -20º C de temperatura? Razona tu respuesta.

EJERCICIO 5: Tengo 1 Kg de glucógeno y 1 kg de grasa ¿Cuál tiene más energía? Razónalo relacionándolo con las distintas propiedades hidrofílicas e hidrofóbicas que exhiben ambos. 

Solución: La grasa tiene más energía que el glucógeno. Esto se debe a que 1 kg de grasa contiene aproximadamente 9 kcal por gramo, mientras que 1 kg de glucógeno contiene alrededor de 4 kcal por gramo.

Desde el punto de vista químico, las grasas son moléculas altamente reducidas (principalmente compuestas por ácidos grasos, que son hidrofóbicos) y almacenan más energía en sus enlaces, en comparación con los carbohidratos como el glucógeno, que es una molécula hidrofílica y altamente ramificada con una mayor proporción de oxígeno en comparación con la grasa.

Además, la grasa se almacena sin agua, mientras que el glucógeno se almacena con una cantidad significativa de agua (alrededor de 3-4 gramos de agua por gramo de glucógeno). Esto significa que el peso de almacenamiento del glucógeno incluye no solo la energía almacenada en la molécula de glucógeno en sí, sino también el agua, lo que reduce la densidad energética total por kilogramo. Por lo tanto, 1 kg de grasa proporcionará más energía que 1 kg de glucógeno.

EJERCICIO 6: Tengo dos células A y B. En ambas hay tres moléculas de glucosa. En A están en forma monomérica y en B en forma polimérica. Si ambas células se encuentran en estrés hídrico ¿Cómo se encontrará la glucosa, como en la célula A o como en la célula B? Razona tu respuesta


EJERCICIO 7: Voy a realizar un experimento para comprobar qué tubérculo tiene mayor concentración de almidón. A) Añado 3 gramos de yuca homogenizada en 3 ml de agua en un tubo. En un segundo tubo añado 5 gramos en 3 ml. En un tercer tubo añado 3 gramos en 5 ml de agua. Añado 5 gotas de colorante en el primer tubo, en el segundo y el tercer tubo. ¿Qué error hemos cometido? Razona tu respuesta. 

EJERCICIO 8: Pesamos 1 gramo de sacarosa y 1 gramo de glucosa. ¿Tenemos el mismo número de moléculas? Razona tu respuesta. 

EJERCICIO 9: ¿Es lo mismo definir la masa de un producto en gramos o en moles?

EJERCICIO 10: Pesamos 1 gramo de almidón (un polímero de glucosa). Pesamos 1 gramo de glucosa. ¿Tenemos el mísmo número de moléculas? Razona tu respuesta

EJERCICIO 11: Tenemos que homogenizar hígado con el mortero. A Pesamos y homogenizamos B Homogenizamos y pesamos C Homogenizamos encima de la balanza.

EJERCICIO 12: Tenemos que añadir 5 gotas. No tenemos pipetero. ¿Podemos utilizar una micropipeta? 

EJERCICIO 13: Tenemos que añadir 0.5 gramos ¿Utilizarías una micropipeta? Razona tu respuesta

EJERCICIO 14: Test de Fehling. ¿Por qué la sacarosa es negativa y la fructosa positiva para este test? Razona tu respuesta.

Solución: La sacarosa es un disacárido que no posee carbonos anoméricos libres por lo que carece de poder reductor. La reacción con el de Fehling es negativa en presencia de ClH (ácido clorhídrico) y en caliente la sacarosa se hidroliza e incorpora la molécula de agua y se descompone en monosacáridos (glucosa y fructosa)

EJERCICIO 15: Test de lugol. ¿Por qué el tubo con almidón se tiñe de negro?

EJERCICIO 16: El test de Benedict, la coloración no es fija, depende de la temperatura ¿Por qué?

EJERCICIO 17: El test de Benedict detecta la glucosa en sangre ¿Es normal tener glucosa en sangre? ¿Por qué es importante detectarlo?

EJERCICIO 18: ¿Por qué la lactosa si es disacárida reacciona con el test de Fehling y la sacarosa, que también es un disacárido, no reacciona?

Solución: es porqué la sacarosa no es un azucar reductor y la lactosa es reductora

EJERCICIO 19: Test de lugol. ¿Cuál sería un control negativo? ¿Cuál sería un control positivo?

Solución


jueves, 21 de junio de 2018

Práctica: Elaboración de un protector solar

Los rayos ultravioleta (UV) son una forma invisible de radiación. Pueden penetrar la piel y dañar las células. Las quemaduras de sol son un signo de daño en la piel. El bronceado tampoco es saludable. Aparece después que los rayos del sol ya mataron algunas células y dañaron otras. Los rayos UV pueden causar lesiones en la piel durante cualquier estación del año y a cualquier temperatura. También pueden causar problemas en los ojos, arrugas, manchas en la piel y cáncer de piel.

El alto costo de los protectores solares comerciales y la exposición laboral a los rayos UV hacen que las poblaciones económicamente menos favorecidas no tengan acceso a una adecuada protección solar la cual incluye, pero no se limita, al uso de pantallas protectoras (protectores solares).

Los protectores solares generalmente están compuestos de un aceite, un emulsificante y el agente protector solar. El óxido de Zinc se utiliza frecuentemente en este tipo de formulaciones no comerciales por ser económico y efectivo, como emulsificante puede emplearse la cera de abeja la cual es ampliamente utilizada en cosmetología y ha demostrado se seguro como emulsificante, al igual que el aceite de almendras cuyo uso es extendido en la fabricación de cosméticos en todo el mundo.

Objetivos de la práctica

Identificar los componentes de una loción protectora solar

Reconocer la naturaleza de los diferentes ingredientes de un protector solar

Elaborar una formulación extemporánea para protección solar

Alcance


Esta práctica de laboratorio incluirá elaboración de un protector solar de bajo costo desde la pesada de sus ingredientes hasta el envasado y rotulado final

Aparatos, equipos e instrumentos

Balanza analítica
Plancha de calentamiento

Materiales y reactivos

10 Espátula cuchareta
10 Probeta 50 mL
10 Vasos de precipitación 100 mL
10 Morteros con pistilo
20 Bandeja para pesar
Reactivos:

Cera de abejas
Aceite de Almendras
Óxido de Zinc

Descripción del procedimiento


1. Medir en una probeta 36 mL de aceite de almendras

2. Pesar 3,8 g de cera de abejas

3. Pesar 6,7 gramos de Óxido de Zinc

4. Mezclar en un vaso de precipitado la cera de abejas y el aceite de almendras calentando en una plancha y agitando vigorosamente con una varilla de vidrio

5. Verter la mezcla en un mortero donde previamente se ha colocado el óxido de zinc y con la ayuda de pistilo mezclar hasta obtener una loción homogénea

6. Envasar en un recipiente plástico y rotular como sigue:

miércoles, 13 de junio de 2018

Práctica de enzimas, catálisis y cinética

El término de catálisis se atribuye al sueco Berzelius, quién en 1836 escribe: algunos cuerpos tienen la propiedad de ejercer sobre otros una acción, diferente a la causada por la afinidad química, por medio de la cual se produce su descomposición, formando nuevos compuestos, que no entraban en la composición de aquellos. A este poder desconocido, común a la naturaleza orgánica e inorgánica, llamo poder catalítico, siendo catálisis la descomposición de cuerpos por esta fuerza. Sería Ostwald, el que nos legó el concepto de catálisis y catalizador, tal como lo conocemos actualmente. Por ejemplo, la descomposición de peróxido de hidrógeno, con producción de oxígeno:

2H2O2(aq) = 2H2O(l) + O2(g) 

Esta reacción tiene una energía de activación de 75 kJ/mol, por eso es muy lenta para visualizarla en fotografía digital. En esta práctica se estudiará la catálisis de descomposición del peróxido de hidrógeno, tomando el sentido berzeliano del término.

Objetivos de la práctica


Reconocer la catálisis y co-catálisis en la descomposición del agua oxigenada y su relación con los procesos de formación de especies reactivas de oxígeno. Identificar reacciones enzimáticas en la descomposición del almidón.

Esta práctica de laboratorio incluirá la determinación de la co-catálisis y la catálisis del peróxido de hidrógeno, la reacción enzimática de descomposición del almidón por acción de la amilasa y la Influencia de la superficie de la muestra del hígado en su acción enzimática.

Aparatos, equipos e instrumentos
Cronómetro 3

Baño maría 1

Materiales y reactivos
‐ 3 rotuladores
‐ 25 Pipetas pasteur plástico 1 mL
‐ 3 Gradilla plastica
‐ 3 Peras de seguridad de 3 vias
‐ 6 Pinzas tubo de ensayo
‐ 3 Mango de bisturi nº 3
‐ 6 Hojas de bisturí #10
‐ 2 Guantes de manejo L
‐ 2 Guantes de manejo M
‐ 2 Guantes de manejo S
‐ 15 Tubos de ensayo pequeños 10 mL
‐ 9 Vasos de precipitación 50 mL
‐ 3 Varilla de vidrio 20cm
‐ 9 Probetas 10 mL
‐ 9 Pipetas volumétrica 5 mL
‐ 3 Mortero
‐ 9 Cajas tripetri plásticas


Reactivos:

‐ 600 mL. de agua destilada
‐ 30mL Peróxido de Hidrógeno 30%
‐ 30mL Cloruro de cobre dihidratado 5%
‐ 30mL Cloruro de Hierro III 5%
‐ 30mL Reactivo de Benedict
‐ 30mL Almidón Indicador (SOLUCIÓN)
‐ 30mL Almidón Soluble
‐ 30mL Lugol

Descripción del procedimiento

Co-catálisis


‐ Colocar 3 gotas de cloruro cúprico y 3 gotas de peróxido de hidrógeno en una caja Petri, no mezclar.
‐ Colocar 3 gotas de cloruro férrico y 3 gotas de peróxido de hidrógeno en una caja Petri, no mezclar.
‐ Tener a la mano un reloj con cronómetro; mezclar la caja del punto 2 y anotar conforme avanza el tiempo el número de gotas desprendidas aproximado durante 5 min.
‐ Tener a la mano un reloj con cronómetro; mezclar la caja del punto 3 y anotar conforme avanza el tiempo el número de gotas desprendidas aproximado durante 5 min.
‐ Colocar 3 gotas de cloruro férrico, 3 gotas de cloruro cúprico y 3 gotas de peróxido de hidrógeno en una caja Petri, no mezclar.
‐ Tener a la mano un reloj con cronómetro; mezclar la caja del punto 6 y anotar conforme avanza el tiempo el número de gotas desprendidas aproximado durante 5 min.

Influencia de la superficie de la muestra del hígado en su acción enzimática
‐ Porción de hígado 1: Macerar + 3 mL de Peróxido de hidrógeno
 ‐ Porción de hígado 2: Dividir en trozos + 3 mL de Peróxido de hidrógeno
Cortamos el hígado en trozos. OJO, debe de pesar lo mismo que el hígado macerado. Lo importante en los experimentos es eliminar variables, por ese motivo debemos tener todo igual excepto que un hígado esté macerado y el otro en trozos 
‐ Comparar las reacciones de los dos montajes.
¿Cuál de las dos preparaciones de hígado descompondrá el H202 en agua y 02 más rápido? ¿Por qué?
Hidrólisis del almidón

‐ Poner en una gradilla cuatro tubos de ensayo, numerados del 1 al 4.
‐ Añadir en cada tubo 2 mL. de una solución diluida de almidón.
‐ A los tubos 3 y 4 añadir una pequeña cantidad de saliva.
‐ En el tubo 1, realizar la Reacción de Benedict: Añadir 1 mL de reactivo de Benedict y mezclar. Colocar el tubo a baño maría a 70°C, durante 5 minutos y luego dejar enfriar.
‐ En el tubo 2, realizar la Reacción de Lugol.
‐ Poner en el baño María a 37°C, a los tubos 3 y 4 (que contienen el almidón y la saliva), controlando la temperatura debido a que la enzima de la saliva funciona a 37°C. Dejar los tubos en el baño María durante 15 minutos.
‐ A continuación, realizar las siguientes reacciones: en el tubo número 3, realizar la Reacción de Fehling o Benedict. En el tubo número 4, realizar la Prueba del Lugol.
Tubo 1: almidón más tinción de Benedict calentado a 70ºC para acelerar la reacción. Tubo 2: almidón más Lugol a temperatura ambiente. Tubo 3: almidón más saliva a 37ºC más tinción de Benedict. Tubo 4: almidón más saliva a 37ºC más Lugol.

viernes, 8 de junio de 2018

Construcción de un árbol filogenético

He realizado esta práctica sólo para que mis alumnos entendiesen el concepto de un progenitor común... y que yo, en particular no he matado a Atahualpa, que quien lo mató posiblemente sea antepasado de ellos. La parte científica de la práctica la han entendido perfectamente, sin embargo, cuando les pregunté "¿Está claro que los españoles actuales no somos responsables de la matanza de indígenas?" la respuesta fue "La parte científica nos ha convencido pero seguimos pensando que los españoles tienen culpa de todo". 
Charles Darwin intuyó en este esquema que todos los organismos estarían relacionados por antepasados comunes y que las especies actuales formarían una especie de árbol filogenético con sus antepasados

Venimos de nuestros antepasados

Piensa en como clasificarías diversos animales. Tradicionalmente, las diferencias físicas entre organismos fueron utilizadas para deducir las relaciones evolutivas entre ellos, por ejemplo, si un organismo tiene una columna vertebral, o si tiene alas. Sin embargo, esto puede causar problemas. Por ejemplo, aves, murciélagos e insectos tienen todos ellos alas, pero ¿están estrechamente relacionados? ¿Cómo calculas el tiempo que ha pasado desde que los organismos divergieron de un ancestro común?
Sabemos por estudios de secuenciación de ADN que las mutaciones ocurren aleatoriamente a un ritmo muy lento y son transmitidas de padres a hijos. De este modo, si asumes que todos los organismos tienen un ancestro común, puedes utilizar las diferencias en secuencias homólogas para medir el tiempo que ha pasado desde que los organismos divergieron. En otras palabras, cuanto más tiempo haya pasado desde que dos especies divergieron de un ancestro común, más diferentes serán sus secuencias de ADN.
Las secuencias homólogas se definen como aquellas secuencias en dos organismos que tienen un origen común. En realidad no tenemos pruebas de que dos secuencias son homólogas (no estuvimos allí para observar el cambio del ADN con el tiempo), pero si son suficientemente similares, a menudo asumimos que son “homólogas”. Para conocer la similitud de dos secuencias, necesitas alinearlas correctamente (pero esto no forma parte de esta actividad).
Hay que tener en cuenta que las diferentes regiones del ADN - regiones codificantes y no codificantes - evolucionan a diferentes velocidades. En general, las regiones codificantes evolucionan más lentamente, ya que una mutación que provoca un cambio en una proteína es generalmente más costoso para el organismo - es menos probable sobrevivir y dejar descendencia. Esto es analizado en la actividad “ADN móvil”.
Para ilustrar el concepto de homología, puedes utilizar el ejemplo de filología - el estudio de la evolución de las lenguas. De hecho, hay muchos paralelismos entre los métodos usados para estudiar la evolución de las lenguas y la de los organismos. Para leer más clica aquí. Como habrás visto en la entrada del blog, las palabras derivadas de “factum” son todas muy parecidas. Cuanto más cerca del origen más se parecen.

Cinco secuencias de ADN de primates
Neandertal (n)   
   TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
Humano (h)    
   TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
Chimpancé (c)   
  TGATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
Gorila (g)            
  TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAGCGCTTGCCGATGTCC
Orangután (o)    
  ACAACCTGCACTCCTATTCTGCCGAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC


TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
TGATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAGCGCTTGCCGATGTCC
ACAACCTGCACTCCTATTCTGCCGAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC


Cuenta el número de diferencias entre cada par de secuencias y anótalo en
Tabla 1: Diferencias entre las secuencias de primates

Neandertal
Humano
Chimpancé
Gorila
Orangután
Neandertal





Humano





Chimpancé





Gorila





Orangután





Calcula el número de nucleótidos diferentes entre dos secuencias dividido por el número total de nucleótidos en cada secuencia y anótalo en: .
Tabla 2: Distancias proporcional entre dos secuencias

Neandertal
Humano
Chimpancé
Gorila
Orangután
Neandertal





Humano





Chimpancé





Gorila





Orangután





Distancia proporcional entre dos secuencias: el número de nucleótidos diferentes entre dos secuencias dividido por el número total de nucleótidos en cada secuencia.

En la tabla, anota el número de nucleótidos diferentes y la diferencia proporcional. Considera las dos especies que son más similares en secuencias: neandertal y humano.
Tabla 3: Distancias evolutivas entre los ancestros de primates y primates

Diferencias
Diferencias proporcional
Neandertal y humano


Neandertal / humano y chimpancé


Neandertal / humano / chimpancé y gorila


Neandertal / humano / chimpancé / gorila y orangután



Usando la tabla 3, puedes empezar a construir el árbol evolutivo:
Conecta neandertales y humanos con una línea. La longitud de las ramas debe corresponder con el tiempo que pasó desde que los humanos y neandertales divergieron de su ancestro común.
Vamos a suponer que se necesitarían 20 millones de años para que cada uno de los nucleótidos de esta particular secuencia de ADN cambien. De este modo, para que la secuencia de ADN cambie un 0.07, se necesitarían 0.07*20 millones = 1.4 millones de años. La rama debe medir por lo tanto, 1.4 millones de años en la escala de tiempo.
Para calcular cuánto tiempo hace que el ancestro de los chimpancés divergió del ancestro de los humanos (longitud de la rama), sumar las diferencias proporcionales en la Tabla 3.

Para calcular las ramas (branches) del árbol se multiplica la distancia proporcional entre dos secuencias por el tiempo en millones de años que se necesitan para que un nucleótido cambie entre dos secuencias
REFERENCIAS:
https://www.scienceinschool.org/es/2010/issue17/bioinformatics
http://bacteriasactuaciencia.blogspot.com/2018/04/la-filogenia-no-tiene-sensibilidad-para.html
https://es.khanacademy.org/science/biology/her/tree-of-life/a/phylogenetic-trees
https://www.researchgate.net/publication/321420152_CONSTRUYENDO_UN_ARBOL_FILOGENETICO_DE_PALABRAS_UN_ENFOQUE_INTERDISCIPLINAR_PARA_LA_ENSENANZA_DE_LA_EVOLUCION

http://webdiis.unizar.es/asignaturas/Bio/wp-content/uploads/2015/05/practica4-5-6.pdf
https://www.youtube.com/watch?v=CZAQFkCprHQ
http://docplayer.es/7711592-Introduccion-a-la-bioinformatica-practica-3-creacion-de-arboles-filogeneticos.html


SOLUCIÓN: Cinco secuencias de ADN de primates

Neandertal (n)   
   TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
Humano (h)    
   TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
Chimpancé (c)   
  TGATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
Gorila (g)            
  TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAGCGCTTGCCGATGTCC
Orangután (o)    
  ACAACCTGCACTCCTATTCTGCCGAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC


n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC

n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
c TGA TCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
 
n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAG CGCTTGCCGATGTCC

n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
o ACAACCTGCACTCCTATTCTGCC GAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC
------------------------------------------------------------------------------------------
h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
c TGA TCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC

h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAG CGCTTGCCGATGTCC

h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
o ACAACCTGCACTCCTATTCTGCC GAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC

------------------------------------------------------------------------------------------
c TGAT CCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAG CGCTTGCCGATGTCC

c TGATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
o ACAACCTGCACTCCTATTCTGCCGAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC

------------------------------------------------------------------------------------------
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAGCGCTTGCCGATGTCC
o ACAACCTGCACTCCTATTCTGCCGAGCCGGGCGCGTGGCAAAGTCC



Cuenta el número de diferencias entre cada par de secuencias y anótalo en
Tabla 1: Diferencias entre las secuencias de primates

Neandertal
Humano
Chimpancé
Gorila
Orangután
Neandertal
0
3
4
11
16
Humano
3
0
5
12
17
Chimpancé
4
5
0
11
14
Gorila
11
12
11
0
14
Orangután
16
17
14
14
0
Calcula el número de nucleótidos diferentes entre dos secuencias dividido por el número total de nucleótidos en cada secuencia y anótalo en:
Tabla 2: Distancias proporcional entre dos secuencias

Neandertal
Humano
Chimpancé
Gorila
Orangután
Neandertal
0
0.07
0.09
0.24
0.33
Humano
0.07
0
0.11
0.26
0.37
Chimpancé
0.09
0.11
0
0.24
0.28
Gorila
0.24
0.26
0.24
0
0.3
Orangután
0.33
0.37
0.28
0.3
0
Distancia proporcional entre dos secuencias: el número de nucleótidos diferentes entre dos secuencias dividido por el número total de nucleótidos en cada secuencia.

En la tabla, anota el número de nucleótidos diferentes y la diferencia proporcional. Considera las dos especies que son más similares en secuencias: neandertal y humano.

n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
c TGA TCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC

h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
c TG ATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
 
Hay cuatro diferencias entre neandertal y chimpancé, y cinco diferencias entre humano y chimpancé. Por consiguiente, la distancia promedio entre neandertal / humano y chimpancé es de 4.5.


n TGGTCCTGCAGTCCTCTCCTGGCGCCCCGGGCGCGAGCGGTTGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCG AGCGCTTGCCGATGTCC

h TGGTCCTGCTGTCCTCTCCTGGCGCCCTGGGCGCGAGCGGATGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAG CGCTTGCCGATGTCC

c TG ATCCTGCAGTCCTCTTCTGGCGCCCTGGGCGCGTGCGGTTGTCC
g TGGACCTGCAGTCATCTTCTGCCCGCCCGAG CGCTTGCCGATGTCC


Tabla 3: Distancias evolutivas entre los ancestros de primates y primates


Diferencias Diferencias proporcional
Neandertal y humano
3
0.07
Neandertal / humano y chimpancé
(4+5)/2= 4.5
4.5/46=0.098
Neandertal / humano / chimpancé y gorila
(11+12+11)/3=11.3
11.3/46=0.24
Neandertal / humano / chimpancé / gorila y orangután
(15+17+13+14)/4=14.75
14.75/46=0.32

Usando la tabla 3, puedes empezar a construir el árbol evolutivo:
Conecta neandertales y humanos con una línea. La longitud de las ramas debe corresponder con el tiempo que pasó desde que los humanos y neandertales divergieron de su ancestro común.
Vamos a suponer que se necesitarían 20 millones de años para que cada uno de los nucleótidos de esta particular secuencia de ADN cambien. De este modo, para que la secuencia de ADN cambie un 0.07, se necesitarían 0.07*20 millones = 1.4 millones de años. La rama debe medir por lo tanto, 1.4 millones de años en la escala de tiempo.
Para calcular cuánto tiempo hace que el ancestro de los chimpancés divergió del ancestro de los humanos (longitud de la rama), sumar las diferencias proporcionales en la Tabla 3.