domingo, 7 de julio de 2019

Árbol genealógico de los Restrepo


El apellido Restrepo aparte de ser un apellido muy colombiano, también es un apellido muy asturiano. Se origino en en la comarca de Castropol en la frontera de Asturias y Galicia en España. La familia Restrepo en ese época era una familia noble y terrateniente de España. Las siguientes secuencias pertenecen a 4 personas apellidadas Restrepo que viven en Castropol, España; Cartagena de Indias, Colombia; Tulcán, Ecuador y Quito.

Individuo SS1: ATTGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA

Individuo XJ:    ATAGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA

Individuo L8:   ATAGT-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCCA-GCTCA

Individuo xx3: ATAGT-CTGTT-ACCCT-CCCCC-AGCCA-GCTCA

Diferencias XJ / SS1 1 diferencia
Individuo SS1: ATTGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
Individuo XJ:    ATAGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA

Diferencias XJ / xx3 6 diferencias
Individuo XJ:   ATAGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
ndividuo xx3:  ATAGT-CTGTT-ACCCT-CCCCC-AGCCA-GCTCA

Diferencias XJ / L8 2 diferencias
Individuo XJ:   ATAGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
Individuo L8:  ATAGT-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCCA-GCTCA

Diferencias xx3 / SS1 7 diferencias
Individuo SS1: ATTGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
Individuo xx3:  ATAGT-CTGTT-ACCCT-CCCCC-AGCCA-GCTCA

Diferencias L8 / SS1 3 diferencias
Individuo L8:   ATAGT-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCCA-GCTCA
Individuo SS1: ATTGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA

Diferencia xx3 / L8 4 diferencias
Individuo xx3: ATAGT-CTGTT-ACCCT-CCCCC-AGCCA-GCTCA
Individuo L8:  ATAGT-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCCA-GCTCA

Diferencias entre individuos
 
En este punto ya podemos saber que el árbol sería SS1 quiteño; XJ tulcaneño; L8 cartagenero y xx3 asturiano

quiteño SS1:            ATTGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
tulcaneño XJ:           ATAGA-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCGA-GCTCA
cartagenero L8:      ATAGT-CTGTT-ACCCT-ACGAT-AGCCA-GCTCA
asturiano xx3:         ATAGT-CTGTT-ACCCT-CCCCC-AGCCA-GCTCA


 Para calcular la distancia proporcional dividimos las diferencias por el número de nucleótidos, en este caso 30. Para calcular las ramas (branches) del árbol se multiplica la distancia proporcional entre dos secuencias por el tiempo en millones de años que se necesitan para que un nucleótido cambie entre dos secuencias. 

Imaginemos que la secuencia estudiada es hipervariable, es decir, que se necesitan 1000 años para que TODOS sus nucleótidos cambien. Si solo cambia 1 de 30, es decir un 0.033% al multiplicarlo por 1000 tenemos que el antepasado común vivió hace 33 años. Obviamente, decir que se necesitan 1000años para que una secuencia de 30 nucleótidos cambie por completo es una exageración. El ADN no cambia tan rápido. Recordad que estamos aprendiendo a "leer" genes. Esto es un ejercicio escolar. La tasa de mutación del ADN humano sería de un cambio de nucleótico cada 2000.000.000 bases por año. O sea, que en 1000 años tendríamos 1000 bases mutadas en 2000.000.000 de bases.

¿El árbol resultante sería? utiliza una línea de tiempo en la que cada cuadrado de tu libreta sean 10 años



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